在《波斯王子：失落王冠》中，玩家能透過「自訂行動版控制」選項全面調整觸控方式，或變更任何相容外接控制器的按鍵配置。
 
若要重新配置按鈕與按鍵：

若使用觸控輸入： 
•  開啟遊戲內的暫停選單並選擇「系統」。
•  選擇「自訂行動版控制」。
•  輕觸畫面上方的「編輯控制」。輕觸想要自訂的按鈕。
•  能調整按鈕的透明度、位置、大小與次要輸入方式。
•  輕觸齒輪圖示以進入進階配置設定。
•  設定好控制後輕觸「儲存」。測試新的控制方式。
•  輕觸畫面左上角的返回按鈕離開，此時遊戲會套用新的控制方式。
 
若要將按鈕重設為預設狀態，可以在「編輯控制」模式中輕觸「重設」。
注意：有些較敏感的部分無法自訂行動版控制。

若使用外接控制器： 
•  連接控制器後，開啟遊戲內的暫停選單並選擇「系統」。
•  選擇「自訂控制」。也能點選「選項」、「控制」，接著點選「自訂控制」。
•  選擇想要調整的按鈕或按鍵。
•  選擇「更改輸入」，然後按下新的按鈕或按鍵。
 
若要將按鈕與按鍵的配置重設為預設狀態，可以使用「重設輸入」。