在《虹彩六號M》中有多種武器。每位特勤幹員在遊戲回合中除了裝備之外，還可以使用兩種武器。主要武器有突擊步槍、衝鋒槍、霰彈槍、輕機槍和精準射手步槍。次要武器有手槍、衝鋒手槍和左輪手槍。