Intégrées aux missions de la campagne principale, les saisons ajoutent un scénario inédit à l'univers d'Invincible, que vous suivez en progressant de chapitre en chapitre. L'histoire principale est divisée en saisons. Il s'agit d'une nouvelle trame scénaristique peuplée de personnages connus, dans laquelle vous rejoignez l'Agence de défense globale pour percer le mystère d'une redoutable armée de clones (et... de vols de viande à burger ?) aux côtés de Cecil Stedman, directeur de l'ADG.