Rainbow Six Mobile propose d’équiper différents types d’armes. Au cours d’une manche, chaque agent peut utiliser deux armes, en complément des gadgets disponibles. Les armes principales peuvent être des fusils d’assaut, des pistolets-mitrailleurs, des fusils à pompe, des fusils-mitrailleurs ou des fusils de précision.  Les armes secondaires peuvent quant à elles être des pistolets, des pistolets automatiques et des revolvers.