Misiones de la historia: sirven para avanzar en la trama, te permiten construir nuevas estancias en la villa, desbloquean nuevas regiones y te otorgan diversas recompensas. Misiones estándar: te otorgan códices para entrenar. Misiones de saqueo: te otorgan materiales para fabricar objetos de equipo. Misiones de legado: cuestan información y te permiten obtener ADN para desbloquear y ascender a tus Assassins. Misiones de grieta: misiones especiales a las que solo se puede acceder durante los eventos y desafíos de grieta de Helix.