Es gibt verschiedene Arten von Waffen in Rainbow Six Mobile. Jeder Operator kann während der Spielrunden zusätzlich zu Gadgets zwei Waffen verwenden. Die Hauptwaffen sind Sturmgewehre, Maschinenpistolen, Schrotflinten, Leichte Maschinengewehre und Scharfschützengewehre. Sekundärwaffen sind Pistolen, Maschinenpistolen und Revolver.